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如何使用ncbi搜索并下载基因序列

基因的全序列是么? OK 进入NCBI,选中mapview选择项。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/ 输入你要下载的基因名称和物种。 举个例子,我要下载小鼠的IGF2基因。 先在下拉菜单中选mus musculus(小鼠的拉丁文), for后面填写IGF2基因(你要

NCBI是生物学科经常使用的搜索引擎,其收纳了大量的基因和蛋白序列,可以对这些序列进行比对、设计引物等,功能非常强大。接下来以下载H9亚型流感病毒HA基因为例为大家介绍如何使用NCBI搜索并下载基因序列。

如何使用ncbi搜索并下载基因序列

方法

利用浏览器搜索NCBI,点击进入官网。

打开ncbi网页,在最上面的搜索框旁边的下拉条选择nucleotide,输入MC1R(有时候需要写全称比较准),点击“search".然后可以看到搜索到的网页的右上角有:Top Organisms [Tree],再点击那个”Tree",可以看到分类群的各种不同种属的数据。点哪个种

如何使用ncbi搜索并下载基因序列 第2张

进入官网后在栏目内选择“Nucleotide”,搜索栏内输入“Avian influenza virus H9 HA”,输入完毕后点击“search”。

OMIM数据库之父Victor Almon McKusick先生是位临床医生。该数据库的最原始的版本是一本叫MIM的遗传学书籍,后来挪到了网上,就加了一个“O”称为在线的人类孟德尔遗传学。所以OMIM数据库不同于其他的NCBI数据库。其设计之初是为临床医生提供在线浏

如何使用ncbi搜索并下载基因序列 第3张

新的页面会显示许多关于“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列,如果其中的一个符合你的要求,就在它序列前的方框打勾即可。也可以根据自身需求继续在搜索条内添加限定,比如添加“2010”,即2010年分离到的病毒。

我现在的文件里有几百个基因的ID(EntrezID),怎样去下载这些ID对应的基因fasta格式的序列?NCBI里有Batchentrez,但是需要的是accession和GI号,我转换完ID之后,都是一

如何使用ncbi搜索并下载基因序列 第4张

选定目的基因序列后,点击界面右上角的“send to”,在“choose destination”中选择“file”,在“format”中选择“FASTA”,最后点击“create file”即可将序列下载到自定义文件夹。

GenBank同二楼说的,还有DDBJ、EMLB,是世界三大核酸数据库,三者各有优缺点,如果要完整菌种的序列,你可以将三者结合使用,希望帮到你。

如何使用ncbi搜索并下载基因序列 第5张

下载完毕后打开所在文件夹就能看到基因序列了。

小鼠的可以下载,牛的恐怕暂时还没有 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/mouse/

如何使用ncbi搜索并下载基因序列 第6张

扩展阅读,以下内容您可能还感兴趣。

我想在NCBI上下载特定物种的Sox21基因的序列?要怎么操作?

这里zd:内容

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Sox21更多追问追答追问我是想下载它的序列,就是ATGC的那些东西。追答  你可以点击那些链接啊,或者你说具体点,你需要那个物种的SOX21,要cDNA还是基因组DNA。追问我没发现连接里面有具体的序列呀?,要基因组DNA追答哪个物种的基因组DNA的SOX21?追问老鼠,人,猩猩,狗都行追答  1. 点下面这个链接:

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=332929391&g=refGene&i=NM_007084&c=chr13&o=95361878&l=95361878&r=95364389&db=hg19

2. 往下拉,点这个地方:Genomic Sequence from assembly,就来到如下页面:

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgc?hgsid=332929391&g=htcGeneInGenome&i=NM_007084&c=chr13&l=95361878&r=95364389&o=refGene&table=refGene

3. 选择好上下游长度,以及其它选项,往下拉,点submit:

你试试看。追问能加下QQ说么?我QQ402758327追答没有用过QQ。

如何在NCBI上寻找果蝇的所有基因名称,并下载。

建议直接看ncbi 网站说明。知道序列号就可以轻松找到该基因了。一个序列号一般对因一个基因呀 !也可用序列队序列比对法直接找一下

我英文不好,谁能教下怎么从NCBI上下载真核原核生物基因序列,具体点

打开NCBI网站知,在search中选择Nucleotide核酸序列,后面输入你想找序列的拉丁文,搜索,点击道序列,选着fasta格式,在上方中间位专置send选择file,create file 就下载下来了,可以属以记事本格式打开

GenBank Release146(http://www.ncbi.nih.gov/Genbank/)基因序列怎么下载的

首先,你的网址就不zhidao对,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/其次,选择数据库,输入你版的基因编号,搜索,然后下载权。追问这个

Release146

怎么下的?

从ncbi下载的全基因组序列压缩包是FNA格式 不能解压怎么办

通常下载基因组序列是fasta或者text格式,用电脑自带的笔记本软件就能打开,没见过下载压缩包这么麻烦的。

标签: 基因 序列 NCBI
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